עמק המעיינות שופע מעיינות ונחלים, בינהם גם נחל חרוד. נחל חרוד מתחיל את דרכו מפסגות גבעת המורה וחוצה את עמק חרוד מזרחה, זורם לאורך 32 ק"מ עד שפכו לירדן.

הנחל הוא עורק הניקוז העיקרי של עמק חרוד.
מקורות המים העיקריים של הנחל היו בעבר מעיינות ונביעות למרגלות רכסי הגלבוע, מעיין יזרעאל ומעיין חרוד ומעיינות פארק המעיינות. היום מקור המים הזורמים בנחל הוא ניקוז שטחים חקלאיים ובריכות דגים. 
מים אלו אינם ראוים לרחצה. 

בנוסף לגשר הקנטרה, יש מספר נקודות מומלצות לאורכו של הנחל שכדאי לבקר בהן.

גן לאומי מעיין חרוד: מעיין חרוד נובע במערה בצלע הגלבוע. מי המעיין זורמים בפלג צלול לתוך בריכת שכשוך גדולה ולעוד פלגים הזורמים במרחבי הגן הלאומי. הכניסה לגן הלאומי בתשלום.

חורשת גדעון: בחורשת גדעון, השוכנת ליד היישוב גדעונה, מערך שבילים הכולל שביל מעגלי שאורכו כ-500 מ' המלווה פלג של נחל חרוד משתי גדותיו ושביל נוסף שפונה מזרחה לצד הפלג ומגיע לשרידי שתי טחנות קמח. השביל הקצר עובר בבריכת גדעונה, בריכה יפהפייה שאורכה כ-15 מ' ועומק המים בה כחצי מטר. 

קניון הבזלת: האתר, הקרוי על שם הגוון השחור שהעניקו מי הנחל למצוקי הגיר שלצדיו, נמצא במורד כביש 90, בסמוך לגשר "הרומי" המזרחי. כאן צונח ערוץ הנחל במפל הגבוה ביותר שבנחל חרוד, שגובהו כ-13 מטרים.

פארק בית שאן: הפארק, שמצוי סמוך לכניסה המערבית של העיר מכביש 7078, בנוי משני צדי נחל חרוד, שגשרון עץ מחבר ביניהם. 

לצד כל אחד מהאתרים האלו הקימו חניון יום מוצל עם שולחנות קק"ל וחנייה מסודרת לרכבים.